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靜態(tài)光散射在生物大分子上的應(yīng)用

2020年9月2日
應(yīng)用領(lǐng)域: 分子量蛋白質(zhì)靜態(tài)光散射(SLS)
儀器: BI-200SMBI-MwA

使用 BI-200SM 測量蛋白質(zhì)樣品的分子量

摘要

靜態(tài)光散射(SLS)能夠測量多分散材料以及具有離散聚集數(shù)樣品(如蛋白質(zhì))的平均分子量。合成聚合物本質(zhì)上是多分散的預期,非常適合使用這種技術(shù)進(jìn)行直接分析建設項目,用平均分子量來更為直觀地表示。以牛血清白蛋白(BSA)為例左右,這種蛋白質(zhì)有三種異構(gòu)體(分子量分別為 66.5kDa 又進了一步、133 kDa 和 200 kDa)智能化,此時平均分子量的含義可能就沒那么清晰。通過將使用傳統(tǒng)靜態(tài)光散射法在廣角光散射系統(tǒng)上測量的分子量與通過尺寸排阻色譜(SEC)實(shí)驗(yàn)得到的相對豐度進(jìn)行比較狀況,可以說明這種關(guān)系的性質(zhì)延伸。

引言

牛血清白蛋白(BSA)是一種易于獲取的蛋白質(zhì),常被用作更復(fù)雜蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)藥物的替代品要求。眾所周知,在生理 pH 值和離子強(qiáng)度附近,BSA 處于三種具有明確聚集數(shù)的異構(gòu)體(單體運行好、二聚體國際要求、三聚體,N agg 分別為 1, 2, 3)的平衡狀態(tài)同期。雖然動態(tài)光散射(DLS)技術(shù)很難解決這些問題新趨勢,但還是存在一定的可能性。而靜態(tài)光散射(SLS)由于不具備分辨能力鍛造,只能得到一個單一的平均分子量新體系。

結(jié)果

SLS proteins zimm plot
bsa light scattering data
圖1 – 在接近生理 pH 值條件下,使用廣角激光光散射系統(tǒng)(BI-200SM)得到的 BSA 靜態(tài)光散射數(shù)據(jù)共謀發展。

這種表達(dá)方式(圖 1)被稱為 Zimm 圖 搖籃,它需要進(jìn)行濃度和角度依賴的光強(qiáng)測量。 Zimm 圖 是一種多角度創造、多濃度的外推法使用,分別外推至零角度和零濃度。測量的濃度分別為 10 mg/mL、3 mg/mL 和 2 mg/mL不難發現,散射角度為 θ = 60°、75°聽得懂、90°推動、105° 和 120o。測得的平均分子量約為 81 kDa設備製造,這個值對于 BSA 單體(66.5 kDa )而言太大有效性,但又明顯低于二聚體(133 kDa)或三聚體(200 kDa)。為了理解這一點(diǎn)重要的,必須考慮到 BSA 單體與多聚體始終處于平衡狀態(tài)充分發揮。

單體 ? 二聚體 ? 三聚體

對于已知材料(在本例中為蛋白質(zhì)),其折光指數(shù)與濃度之間的關(guān)系是已知的高端化。如果該物質(zhì)的折光指數(shù)增量(dn/dc)已知全面展示,就可以確定其絕對濃度。

dn/dc 是折射率(ns)對濃度作圖并外推至零濃度時的斜率。其中講理論,ns 是溶液的折射率有望。該斜率在很寬的濃度范圍內(nèi)通常呈線性,因此極限斜率往往與稀溶液條件下的斜率相同解決問題。

這類似于在已知摩爾消光系數(shù)的條件下服務效率,通過在 280 nm 處的紫外吸光度測量來確定濃度。在下面所示的色譜實(shí)驗(yàn)(圖2)中導向作用,初始濃度是已知的蓬勃發展,因此即使沒有任何外部校準(zhǔn),也可以確定每種物質(zhì)的相對豐度重要意義。

chromatogram of BSA
圖2 – 使用 500 μL 定量環(huán)將 10 mg/mL BSA 注入 GPC 系統(tǒng)的色譜圖問題。注入的蛋白質(zhì)總質(zhì)量為 0.5 mg。

微分折光指數(shù)(圖2)與濃度成正比效率,因此可以從數(shù)量上對各組分(單體和二聚體)的相對含量進(jìn)行量化。雖然認(rèn)為存在三聚體,但由于其含量過低十大行動,僅通過折光指數(shù)無法識別重要性。在知道 BSA 單體和二聚體的相對濃度后,就有可能進(jìn)一步評估上文單獨(dú)使用 SLS 測量的結(jié)果(圖1)體系。通過對光散射中固有的光強(qiáng)權(quán)重的理解系統穩定性,可以根據(jù)這些組分的相對含量來估算平均分子量。

chromatograms of BSA using light scattering
圖3 – 使用 BI-MwA 多角度激光光散射儀(MALS)得到的色譜圖平臺建設。

請注意重要組成部分,雖然通過示差(RI,圖 2)只能識別出二聚體和單體先進技術,但 MALS 圖譜(圖3)能清晰地識別出三聚體、二聚體和單體貢獻力量。在此合作,三個峰的相對面積隨散射角度而變化,其中最大的分子在小角度下的散射最為強(qiáng)烈前景。這種量化方法用于探究不同權(quán)重的影響,并將其與圖 1 中得到的分子量進(jìn)行比較。

平均分子量(MW)通過以下表達(dá)式計算得出:

單體 N=1 = 66.5 kDa

二聚體 N=2 = 2×66.5 kDa = 133 kDa

三聚體 N=3 = 3×66.5 kDa = 200 kDa

平均分子量(MW)= ( X% 單體 × 66.5 kDa ) + ( Y% 二聚體 × 133 kDa ) + ( Z% 三聚體 × 200 kDa )

表1 – 基于各組分(N=1進一步、2 和 3)相對豐度預(yù)測的平均分子量宣講手段。

平均分子量計算依據(jù) 單體分子量(kDa) 單體 二聚體 三聚體 平均分子量(kDa)
MALS 130 度角下的光強(qiáng)加權(quán)66.580.8%13.5%5.7%83.0
MALS 105 度角下的光強(qiáng)加權(quán)66.580.0%13.6%6.5%84.1
MALS 90 度角下的光強(qiáng)加權(quán)66.578.7%13.6%7.7%85.7
RI 信號的數(shù)量加權(quán)66.589.1%10.9%0.10%74.0

示差信號能夠直接反映給定材料的濃度,而散射光強(qiáng)則是分子量與濃度共同作用的結(jié)果部署安排。因此競爭激烈,僅基于光強(qiáng)加權(quán)的分子量會高估較大分子(特別是二聚體和三聚體)的貢獻(xiàn)⌒Ч?;叵胍幌聦W習,單獨(dú)使用 SLS 測得的分子量約為81 kDa技術,這與表 1 所示基于光強(qiáng)加權(quán)得到的分子量結(jié)果非常接近。

總結(jié)

  1. 蛋白質(zhì)中通常有多種具有不同聚集數(shù)的組分處于平衡狀態(tài)(以 BSA 為例,聚集數(shù) N agg分別為1結構重塑、2、3)空白區。
  2. 從 Zimm 圖獲得的任何分子量都是這三種異構(gòu)體的平均值貢獻法治。
  3. 當(dāng)與色譜分離方法(在本案例中為 GPC)聯(lián)用時,折光指數(shù)可用于測量不同分子量組分的相對豐度應用優勢。
  4. 使用以下兩種方法計算平均分子量相對簡單:(i)光強(qiáng)加權(quán)相對較高;(ii)數(shù)量加權(quán)。

結(jié)論

靜態(tài)光散射可用于測量多分散樣品(包括蛋白質(zhì))的分子量分享。生物樣品通常具有明確的聚集數(shù)(單體現場、二聚體等)。在平衡控制的自締合情況下(如蛋白質(zhì)二聚化)開展研究,各組分非常明確高質量,因此分子量將是彼此的整數(shù)倍。本文探討了多組分體系中靜態(tài)光強(qiáng)力量、分子量和相對濃度之間的關(guān)系可靠。

參考文獻(xiàn)

  • Zimm, Bruno H., “Apparatus and Methods for Measurement and Interpretation of the Angular Variation of Light Scattering”, J. Chem. 16, 1099 (1948).
  • J. C. Moore, “Gel permeation chromatography. I. A new method for molecular weight distribution of high polymers”, J. Polym. Sci., A-2, 835 (1964).
  • Weiner, Bruce B., “Let There Be Light: Characterizing Physical Properties of Colloids, Nanoparticles & Proteins Using Light Scattering”, Amazon, (2019).

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